Servicios SeqUOH

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Servicio seqUOH

Secuenciación de alta precisión (long-reads)

Secuenciación Oxford Nanopore para lecturas largas, ensamblaje de novo, metagenómica y análisis epigenético a escala genómica.

Aplicaciones

  • Ensamblaje de novo y resolución estructural
  • Proyectos con regiones repetitivas o variantes complejas
  • Metagenómica con recuperación de genomas completos

Qué incluye

  • Selección de MinION o PromethION según rendimiento requerido
  • Generación de datos en tiempo real
  • Control de calidad de lecturas
  • Coordinación con análisis bioinformático downstream

Descripción del servicio

Usando los dispositivos PromethION y MinION de Oxford Nanopore, el laboratorio realiza secuenciación de ADN y ARN en tiempo real, lo que permite obtener datos inmediatos y realizar análisis rápidos. PromethION se utiliza para proyectos de secuenciación que requieran un rendimiento superior a 30Gb por muestra, mientras que MinION está orientado a aplicaciones más específicas que requieren rendimientos menores a 30Gb. Para las secuencias de ADN, Nanopore es la única plataforma que permite simultáneamente detectar marcas epigenéticas y bases nitrogenadas a escala genómica. En transcriptoma, Nanopore permite resolver las complejidades del splicing alternativo y en muestras metagenómicas permite recuperar un gran porcentaje de genomas bacterianos completos. Nanopore es por defecto la tecnología utilizada para el ensamble de novo de todo tipo de genomas. En SeqUOH tenemos una amplia experiencia en ensamblaje y anotación de genomas que nos convierte en líderes de proyectos emblemáticos como 1000 Genomas y el primer genoma chileno T2T, entre otros.