Servicio seqUOH
Secuenciación de lecturas cortas (short-reads)
Secuenciación MGI mediante alianza HaploX para genomas, transcriptomas y estudios de alto rendimiento con costos competitivos.
Aplicaciones
- WGS, exoma, RNA-seq, metagenómica y metabarcoding
- Estudios con muchas muestras o necesidad de alto rendimiento
- Proyectos que requieren datos FASTQ estandarizados
Qué incluye
- QC local SeqUOH antes del envío
- Secuenciación en plataformas MGI
- Recepción y revisión de métricas de calidad
- Integración con análisis bioinformático estándar o avanzado
Descripción del servicio
Gracias a nuestra alianza estratégica con HaploX (China), utilizamos las plataformas MGI para ofrecer servicios de secuenciación de genomas completos y transcriptomas con precios altamente competitivos. Este acuerdo nos permite combinar la capacidad productiva de HaploX con el control de calidad y la experiencia bioinformática de SeqUOH, asegurando resultados fiables y tiempos de entrega optimizados.
Flujo de trabajo integrado
- Control de calidad (QC) local – SeqUOH
- Verificación de concentración, pureza e integridad de ADN/ARN.
- Selección de librerías adecuadas y validación mediante tapeStation.
- Envío seguro de muestras
- Embalaje con cadena de custodia y trazabilidad en tiempo real hasta HaploX.
- QC adicional y secuenciación – HaploX
- Confirmación de parámetros de calidad.
- Secuenciación en plataformas MGI con cobertura acorde a cada proyecto.
- Análisis de datos – SeqUOH
- Recepción de archivos FASTQ y evaluación de métricas de secuenciación.
- Transcriptómica: alineamiento, cuantificación y análisis de expresión diferencial.
- Genómica: llamado y anotación de variantes (SNPs, indels, CNVs) y generación de informes automáticos utilizando nextflow.
Esta sinergia entre HaploX y SeqUOH nos permite ofrecer un servicio de “punta a punta”, desde la verificación inicial de las muestras hasta la entrega de resultados interpretados, manteniendo altos estándares de calidad y costos accesibles para nuestros usuarios.